RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	P2RY11	Q96G91	374 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	OSBPL11	Q9BXB4	747 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SPC25	Q9HBM1	224 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0A0MRY4	1105 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292		M0QYT0	321 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SPDYE6	P0CI01	402 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	EPHX2	P34913	555 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CA8	P35219	290 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	GRTP1	Q5TC63	336 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PMF1	Q6P1K2	205 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA13	Q96N96	652 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	POMK	Q9H5K3	350 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SYCE1L	A8MT33	242 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	BAIAP3	O94812	1187 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CDH13	P55290	713 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CPNE1	Q99829	537 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	EMCN	Q9ULC0	261 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BNX3	289 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ALB	P02768	609 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MAGEA8	P43361	318 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	GRM3	Q14832	879 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	LY6K	Q17RY6	165 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DLG3	Q92796	817 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	HPS1	Q92902	700 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	SORT1	Q99523	831 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDH12	Q9NPG4	1184 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PPME1	Q9Y570	386 aa		9.98	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	YDJC	A8MPS7	323 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NRP1	O14786	923 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	E2F6	O75461	281 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RABGGTB	P53611	331 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	TPI1	P60174	286 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MAPRE2	Q15555	327 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	APBB2	Q92870	758 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ACAD9	Q9H845	621 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	HMX2	A2RU54	273 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	PLOD2	O00469	737 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	MFSD11	O43934	449 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	CBFA2T3	O75081	653 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	EDN1	P05305	212 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	FAS	P25445	335 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ASPA	P45381	313 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	BAG6	P46379	1132 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RXRG	P48443	463 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RAD23A	P54725	363 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	ITGA7	Q13683	1181 aa		9.97	□□□□□ -0.81
ERCC3-208	ENST00000491292	RGS21	Q2M5E4	152 aa		9.97	□□□□□ -0.81

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