RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 IL37Q9NZH6 218 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.76□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.76□□□□□ -1.33
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PRPF40A-210ENST00000489741 PDE6CP51160 858 aa6.75□□□□□ -1.33
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PRPF40A-210ENST00000489741 TAF10Q12962 218 aa6.74□□□□□ -1.33
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PRPF40A-210ENST00000489741 TCEAL3Q969E4 200 aa6.74□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 MMS19Q96T76 1030 aa6.74□□□□□ -1.33
PRPF40A-210ENST00000489741 CGRRF1Q99675 332 aa6.74□□□□□ -1.33
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PRPF40A-210ENST00000489741 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.74□□□□□ -1.33
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