RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, human

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTDSPL-208	ENST00000486978	LGI2	Q8N0V4	545 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	DEFB106A	Q8N104	65 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	FOXJ1	Q92949	421 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	RNF34	Q969K3	372 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	RRN3	Q9NYV6	651 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	STIM2	Q9P246	746 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978		F5H5T6	163 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	EPHB6	O15197	1021 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	GFPT2	O94808	682 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	ASL	P04424	464 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	EPHX1	P07099	455 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	MME	P08473	750 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TACR2	P21452	398 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	GLDC	P23378	1020 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	CD70	P32970	193 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	HNF1B	P35680	557 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SOX5	P35711	763 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TPMT	P51580	245 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	COPA	P53621	1224 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	JAM2	P57087	298 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	NOMO3	P69849	1222 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	UBXN1	Q04323	297 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	NME3	Q13232	169 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SERINC3	Q13530	473 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	NCAPH	Q15003	741 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SYCP1	Q15431	976 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	XYLT1	Q86Y38	959 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	NEK11	Q8NG66	645 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TTC17	Q96AE7	1141 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	C18orf8	Q96DM3	657 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	LMLN	Q96KR4	655 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	SPAG5	Q96R06	1193 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM245	Q9H330	911 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	FBRS	Q9HAH7	460 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TMEM51	Q9NW97	253 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	COX16	Q9P0S2	106 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978		A0A1B0GTQ1	180 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978		A0A1B0GVM2	712 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978		M0QYT0	321 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CTDSPL-208	ENST00000486978	MOCS3	O95396	460 aa		6.61	□□□□□ -1.35

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