RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	QPCT	Q16769	361 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	INSC	Q1MX18	579 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	C5orf22	Q49AR2	442 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	RTP2	Q5QGT7	225 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	BBS5	Q8N3I7	341 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	GDAP1	Q8TB36	358 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ISL2	Q96A47	359 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM169	Q96HH4	297 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF558	Q96NG5	402 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	AGAP3	Q96P47	875 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	OSER1	Q9NX31	292 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SYBU	Q9NX95	663 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	MID2	Q9UJV3	735 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	COL4A6	Q14031	1691 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101		A0A1W2PPM1	405 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101		F5H5T6	163 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	TLR5	O60602	858 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	GPR37L1	O60883	481 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	TGDS	O95455	350 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	UROD	P06132	367 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	CLTB	P09497	229 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	CRHR1	P34998	444 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ETFB	P38117	255 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ETV4	P43268	484 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SERPINB8	P50452	374 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	DSG1	Q02413	1049 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	TLE2	Q04725	743 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	CDK18	Q07002	472 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	IL10RB	Q08334	325 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SETDB1	Q15047	1291 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM60	Q495X7	471 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PCID2	Q5JVF3	399 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ATG16L1	Q676U5	607 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PACS1	Q6VY07	963 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	MPP5	Q8N3R9	675 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	MYRFL	Q96LU7	910 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	RANBP9	Q96S59	729 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	KIFC1	Q9BW19	673 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	CWH43	Q9H720	699 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PLLP	Q9Y342	182 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		9.81	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	SLC12A8	A0AV02	714 aa		9.8	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	RAMP2	O60895	175 aa		9.8	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ATP5H	O75947	161 aa		9.8	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	ABLIM3	O94929	683 aa		9.8	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	APOA4	P06727	396 aa		9.8	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	PYGB	P11216	843 aa		9.8	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	BMP1	P13497	986 aa		9.8	□□□□□ -0.84
UFD1-208	ENST00000484101	CES1	P23141	567 aa		9.8	□□□□□ -0.84

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