RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 HDAC11Q96DB2 347 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TSGA13Q96PP4 275 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 GABRG3Q99928 467 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CTAGE9A4FU28 777 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 K7ERQ8 282 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CES2O00748 559 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 NCAM2O15394 837 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ATP9BO43861 1147 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 DCNP07585 359 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SRCP12931 536 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PRLRP16471 622 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MX2P20592 715 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PRKCHP24723 683 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 IL10RBQ08334 325 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SLC20A2Q08357 652 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 NOMO1Q15155 1222 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 RETSATQ6NUM9 610 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SH2D3CQ8N5H7 860 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 FRS2Q8WU20 508 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 P3H4Q92791 437 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 FATE1Q969F0 183 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 HAUS1Q96CS2 278 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PBKQ96KB5 322 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CD248Q9HCU0 757 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.35■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 STK25O00506 426 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CEP104O60308 925 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CLCN6P51797 869 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PDK1Q15118 436 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CHPFQ8IZ52 775 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ACTL9Q8TC94 416 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 LRRN4Q8WUT4 740 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 LGMNQ99538 433 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 C2orf42Q9NWW7 574 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SLC25A13Q9UJS0 675 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PLA2G4CQ9UP65 541 aa20.34■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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ACTB-210ENST00000477812 WASH3PC4AMC7 463 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SGK1O00141 431 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 NTSR1P30989 418 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZNF33AQ06730 810 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 E2F5Q15329 346 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MAML1Q92585 1016 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MS4A14Q96JA4 679 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZNF599Q96NL3 588 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SP110Q9HB58 689 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.33■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TTC34A8MYJ7 566 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 ZNF185O15231 689 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 TMCC1O94876 653 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 FGGP02679 453 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 HLA-EP13747 358 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 CCNCP24863 283 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 MAGEA9P43362 315 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 XRCC4Q13426 336 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 FBXL6Q8N531 539 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 TMEM105Q8N8V8 129 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 IER2Q9BTL4 223 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 CEP44Q9C0F1 390 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 BRD8Q9H0E9 1235 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 MTG2Q9H4K7 406 aa20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PQF6 199 aa20.31■□□□□ 0.84
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