RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470243.5

SRRM1-208, Transcript of serine and arginine repetitive matrix 1, human

TSL 5

Gene SRRM1, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRRM1-208	ENST00000470243	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRRM1-208	ENST00000470243	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRRM1-208	ENST00000470243	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRRM1-208	ENST00000470243	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SRRM1-208	ENST00000470243	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SRRM1-208	ENST00000470243	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	ZNF521	Q96K83	1311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SEPT4	O43236	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	GCAT	O75600	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	GC	P02774	474 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	XBP1	P17861	261 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	IGFBP2	P18065	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	PROZ	P22891	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	PNPLA4	P41247	253 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	PCP4	P48539	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	CACNA2D1	P54289	1103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC37A1	P57057	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SHC2	P98077	582 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	CDK18	Q07002	472 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	KLF10	Q13118	480 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	MAPK7	Q13164	816 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	UROC1	Q96N76	676 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	CEP290	O15078	2479 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	MUC3A	Q02505	3323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	ABCC6	O95255	1503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	CRB1	P82279	1406 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243		A0A087X1B8	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243		H3BNC9	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243		H7C1Q1	480 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SMIM22	K7EJ46	135 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	PEX12	O00623	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	CYP3A7	P24462	503 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	VAMP2	P63027	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TMF1	P82094	1093 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	MPP1	Q00013	466 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	GPR150	Q8NGU9	434 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	KCNJ9	Q92806	393 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	HVCN1	Q96D96	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TESK2	Q96S53	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	TSPAN3	O60637	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	RAMP2	O60895	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	JTB	O76095	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SRRM1-208	ENST00000470243	CD4	P01730	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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