RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 SEL1L2Q5TEA6 688 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC181Q5TID7 509 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 RETSATQ6NUM9 610 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SPEM1Q8N4L4 309 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 MYO19Q96H55 970 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM245Q9H330 911 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 MTG2Q9H4K7 406 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 KCND1Q9NSA2 647 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 DTLQ9NZJ0 730 aa9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 A0A1W2PQF6 199 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 BNIP3LO60238 219 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 MAFKO60675 156 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 PRAMEF11O60813 436 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 VAV1P15498 845 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 COL9A1P20849 921 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TGM2P21980 687 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 PTPN7P35236 360 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 GARSP41250 739 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CXCL12P48061 93 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 IL10RBQ08334 325 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SLC20A2Q08357 652 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 GALNT2Q10471 571 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 ENPP2Q13822 863 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 STARD3Q14849 445 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 DLG2Q15700 870 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CRY1Q16526 586 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 Q6ZVU0 165 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 BBS12Q6ZW61 710 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SYT13Q7L8C5 426 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 KDM1BQ8NB78 822 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CCNYQ8ND76 341 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 P3H4Q92791 437 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 HHIPQ96QV1 700 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 WDR24Q96S15 920 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 GABRG3Q99928 467 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 IER2Q9BTL4 223 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CARD9Q9H257 536 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TNKS2Q9H2K2 1166 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 PDFQ9HBH1 243 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 HS3ST2Q9Y278 367 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 LAMTOR5O43504 91 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 ATP9BO43861 1147 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CEP104O60308 925 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SIN3BO75182 1162 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TMCC1O94876 653 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TJP3O95049 919 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CD160O95971 181 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 MX2P20592 715 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 NR2C2P49116 596 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CCR3P51677 355 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CLCN6P51797 869 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 DGKEP52429 567 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 AP1B1Q10567 949 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 PDK1Q15118 436 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 C22orf39Q6P5X5 142 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TSSK4Q6SA08 328 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 CACUL1Q86Y37 369 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 C1orf210Q8IVY1 113 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TSTD1Q8NFU3 115 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 FRS2Q8WU20 508 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 NSMCE1Q8WV22 266 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 HMGB4Q8WW32 186 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 OLFM3Q96PB7 478 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 LGMNQ99538 433 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 TM6SF2Q9BZW4 377 aa9□□□□□ -0.97
CASQ1-202ENST00000467691 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms