RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 SEMA3BQ13214 749 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 MAMLD1Q13495 774 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 FAM131CQ96AQ9 280 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM131Q92545 1883 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 LRRC72A6NJI9 287 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 PLK4O00444 970 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 BNIP3LO60238 219 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 GZMAP12544 262 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 CLCN6P51797 869 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 ADPRHP54922 357 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 PIP4P1Q86T03 277 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 RETREG1Q9H6L5 497 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 ATP13A1Q9HD20 1204 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 TM9SF3Q9HD45 589 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM248Q9NWD8 314 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 FRYQ5TBA9 3013 aa24.22■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 UPK3BL1B0FP48 263 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 UPK3BL2E5RIL1 263 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 SKILP12757 684 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 MAPKAPK2P49137 400 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 FAM46CQ5VWP2 391 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 DEFB124Q8NES8 71 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 OR2A12Q8NGT7 310 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 OR14C36Q8NHC7 312 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 PARVAQ9NVD7 372 aa24.21■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 CTSLP07711 333 aa24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 ACVRL1P37023 503 aa24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 ARF5P84085 180 aa24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 EFHC2Q5JST6 749 aa24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 C22orf39Q6P5X5 142 aa24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 TMC6Q7Z403 805 aa24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 DNAI1Q9UI46 699 aa24.2■■□□□ 1.47
HOXB3-202ENST00000460160 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1B0GVT2 93 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1W2PQJ5 194 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 CEACAM1P13688 526 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 CD59P13987 128 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 L1CAMP32004 1257 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 POM121L1PQ3SYA9 428 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 RETSATQ6NUM9 610 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 EBF2Q9HAK2 575 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 FZD10Q9ULW2 581 aa24.2■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 A0A1W2PPC4 97 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 RTN2O75298 545 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 CHRNA3P32297 505 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 GRIA4P48058 902 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 CCR5P51681 352 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 SLC20A2Q08357 652 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 CNTN1Q12860 1018 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 AGBL4Q5VU57 503 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 HGSNATQ68CP4 663 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 LAYNQ6UX15 382 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC114Q96M63 670 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 TNKS2Q9H2K2 1166 aa24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 SLC7A4O43246 635 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 CD160O95971 181 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 ETFBP38117 255 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 AIF1P55008 147 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 SLC14A1Q13336 389 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 CHST14Q8NCH0 376 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM7Q9C029 511 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 CEP44Q9C0F1 390 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 MAGEH1Q9H213 219 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 IL21RQ9HBE5 538 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 IFNKQ9P0W0 207 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 ACTL7AQ9Y615 435 aa24.18■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 AKAP13Q12802 2813 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM191CA6NGB0 347 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 RNF103O00237 685 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 PSMA2P25787 234 aa24.17■■□□□ 1.46
HOXB3-202ENST00000460160 EPHB2P29323 1055 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms