RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 CSRP3P50461 194 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 PCID2Q5JVF3 399 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 AFMIDQ63HM1 303 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 SPATA22Q8NHS9 363 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 TTC8Q8TAM2 541 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 SERPINB11Q96P15 392 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 GPR22Q99680 433 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 SLC39A8Q9C0K1 460 aa28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 EOMESO95936 686 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 C2P06681 752 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 AOC1P19801 751 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 GMPRP36959 345 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 DSC1Q08554 894 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ITGA9Q13797 1035 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 SLC39A12Q504Y0 691 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 LRRC49Q8IUZ0 686 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 NMUR1Q9HB89 426 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 DNAJC28Q9NX36 388 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 MIA3Q5JRA6 1907 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 B2RBV5 119 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 OAZ2O95190 189 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 GEMP55040 296 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ANO4Q32M45 955 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 PKN3Q6P5Z2 889 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 GIMAP7Q8NHV1 300 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 RHOJQ9H4E5 214 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 CAB39LQ9H9S4 337 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 FNIP2Q9P278 1114 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.11■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 B4GALT3O60512 393 aa28.1■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ARRB2P32121 409 aa28.1■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa28.1■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 A0A1W2PQH9 124 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 E2F8A0AVK6 867 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 E9PAM4 449 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 MAGEC1O60732 1142 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 CABYRO75952 493 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 OR4Q2P0C623 313 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 MYL4P12829 197 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 TUBP50607 506 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 RCN2Q14257 317 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 DLG2Q15700 870 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 RABGAP1LQ5R372 815 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ATG14Q6ZNE5 492 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
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CERS1-201ENST00000429504 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 TNS4Q8IZW8 715 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP28.09■■■□□ 2.09
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CERS1-201ENST00000429504 SCML2Q9UQR0 700 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 HS3ST4Q9Y661 456 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 G3V2L1 256 aa28.09■■■□□ 2.09
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CERS1-201ENST00000429504 APOA4P06727 396 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 RAP1GDS1P52306 607 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ARHGAP8P85298 464 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 IRF9Q00978 393 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 DENND5AQ6IQ26 1287 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 MSANTD2Q6P1R3 559 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 POTEHQ6S545 545 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 MAVSQ7Z434 540 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 LCA5Q86VQ0 697 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 MON1AQ86VX9 555 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ZNF280BQ86YH2 543 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 SCN4BQ8IWT1 228 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 IPMKQ8NFU5 416 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 C1orf74Q96LT6 269 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ZIC5Q96T25 663 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 NMRAL1Q9HBL8 299 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 NDFIP2Q9NV92 336 aa28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 WASH4PA8MWX3 477 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 DDHD2O94830 711 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 F7P08709 466 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ADRA1AP35348 466 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 PGM1P36871 562 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ABCG1P45844 678 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 CPA2P48052 419 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 SLC24A5Q71RS6 500 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 C1orf21Q9H246 121 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa28.08■■■□□ 2.09
CERS1-201ENST00000429504 TLR6Q9Y2C9 796 aa28.08■■■□□ 2.09
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