RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 MAXP61244 160 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 SLC10A7Q0GE19 358 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 POU6F1Q14863 301 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 RFWD3Q6PCD5 774 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ARMC2Q8NEN0 867 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 AZIN2Q96A70 460 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM169Q96HH4 297 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 MECRQ9BV79 373 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 VPS11Q9H270 941 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 MANSC1Q9H8J5 431 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 COMMD8Q9NX08 183 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 PLLPQ9Y342 182 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 TPP1O14773 563 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 SOD2P04179 222 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 NEFHP12036 1026 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJB2P25686 324 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 PCSK7Q16549 785 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 OTOAQ7RTW8 1153 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 NT5MQ9NPB1 228 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa23.61■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ITGA2BP08514 1039 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINB4P48594 390 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 RING1Q06587 406 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 LINC00523Q86TU6 105 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 FSD1LQ9BXM9 530 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 SP110Q9HB58 689 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM51Q9NW97 253 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF212Q9UDV6 495 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 STARD13Q9Y3M8 1113 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 BGNP21810 368 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 OR1E1P30953 314 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 CHRNA4P43681 627 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ITKQ08881 620 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ANO4Q32M45 955 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF333Q96JL9 665 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF558Q96NG5 402 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 DNMT3LQ9UJW3 386 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 SOX13Q9UN79 622 aa23.6■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 E2F8A0AVK6 867 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 TACR2P21452 398 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 CNTFP26441 200 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 PDE1BQ01064 536 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 OVGP1Q12889 678 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 DENND5AQ6IQ26 1287 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC49Q8IUZ0 686 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 LGI2Q8N0V4 545 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 GRAMD1AQ96CP6 724 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 FNIP2Q9P278 1114 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF840PA6NDX5 716 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 DRGXA6NNA5 263 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 PSMD3O43242 534 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ACRP10323 421 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 SLC6A4P31645 630 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 GMPRP36959 345 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 IRX4P78413 519 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 STRA8Q7Z7C7 330 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 KCNMB4Q86W47 210 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 SLC39A11Q8N1S5 342 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 MRGPRX2Q96LB1 330 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 KDM4CQ9H3R0 1056 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.59■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 COCHO43405 550 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 RAMP2O60895 175 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ACVRL1P37023 503 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ETFBP38117 255 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 GP5P40197 560 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 GEMP55040 296 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 PLD1Q13393 1074 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 NAB1Q13506 487 aa23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEB16A2A368 324 aa23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 ABLIM3O94929 683 aa23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 ADRA1AP35348 466 aa23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 PPM1JQ5JR12 505 aa23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 MARC1Q5VT66 337 aa23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 TIFABQ6ZNK6 161 aa23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 CPNE1Q99829 537 aa23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 CAPN7Q9Y6W3 813 aa23.58■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.57■■□□□ 1.36
FAAP20-209ENST00000428120 F5H5T6 163 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.9 ms