RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 OR6B2Q6IFH4 312 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 GPR180Q86V85 440 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SLC47A2Q86VL8 602 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 CATSPERZQ9NTU4 200 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RFPL2O75678 378 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ASNSP08243 561 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MYBP10242 640 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MYL12AP19105 171 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 PGDP52209 483 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MTM1Q13496 603 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 CA9Q16790 459 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SPOCK2Q92563 424 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MYLPFQ96A32 169 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ASB9Q96DX5 294 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF263O14978 683 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RPS9P46781 194 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MAB21L1Q13394 359 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 UBE2SQ16763 222 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 GJB7Q6PEY0 223 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 GREM2Q9H772 168 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 H3BNH8 94 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 NOL4O94818 638 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ATP6V0D1P61421 351 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 OR8K3Q8NH51 312 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 TPP1O14773 563 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RBP1P09455 135 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 NPR2P20594 1047 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SOX11P35716 441 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 PEX3P56589 373 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 GIT2Q14161 759 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 PDK2Q15119 407 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SPARTQ8N0X7 666 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 CBR4Q8N4T8 237 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 FAM136AQ96C01 138 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ERLEC1Q96DZ1 483 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 C2orf71A6NGG8 1288 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MYL12BO14950 172 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 FAM189A1O60320 539 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 FOXN2P32314 431 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 XKR5Q6UX68 686 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RCN3Q96D15 328 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 DNPEPQ9ULA0 475 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.55□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ALOX15BO15296 676 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SERPINA1P01009 418 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MERTKQ12866 999 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 TLR1Q15399 786 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 TRPV1Q8NER1 839 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RAD54BQ9Y620 910 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 IGKV5-2P06315 115 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RCVRNP35243 200 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 NR2C2P49116 596 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 CD83Q01151 205 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 GRM2Q14416 872 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 ULK4Q96C45 1275 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RNFT2Q96EX2 444 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.54□□□□□ -1.36
SBNO1-202ENST00000420886 SH3D21A4FU49 640 aa6.54□□□□□ -1.36
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