RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 Q6ZNB5 142 aa21.36■■□□□ 1.01
GPC1-202ENST00000420138 TEX26Q8N6G2 289 aa21.36■■□□□ 1.01
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GPC1-202ENST00000420138 PAFAH2Q99487 392 aa21.36■■□□□ 1.01
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GPC1-202ENST00000420138 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa21.33■■□□□ 1.01
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