RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419302.1

PDCL2P1-201, Transcript of phosducin-like 2 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PDCL2P1, Length 352 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2P1-201ENST00000419302 PMS2CLQ68D20 193 aa3.16□□□□□ -1.9
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZNF449Q6P9G9 518 aa3.16□□□□□ -1.9
PDCL2P1-201ENST00000419302 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PDCL2P1-201ENST00000419302 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa3.16□□□□□ -1.9
PDCL2P1-201ENST00000419302 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PDCL2P1-201ENST00000419302 POC1AQ8NBT0 407 aa3.16□□□□□ -1.9
PDCL2P1-201ENST00000419302 IL17FQ96PD4 163 aa3.16□□□□□ -1.9
PDCL2P1-201ENST00000419302 PKP4Q99569 1192 aa3.16□□□□□ -1.9
PDCL2P1-201ENST00000419302 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.16□□□□□ -1.9
PDCL2P1-201ENST00000419302 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 C17orf102A2RUQ5 167 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM247A6NEH6 219 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 MMP3P08254 477 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 GSTM2P28161 218 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 RCAN1P53805 252 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 RAB30Q15771 203 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRT71Q3SY84 523 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM209BQ5JX69 171 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 SPATA20Q8TB22 786 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM163Q8TC26 289 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 HMGB4Q8WW32 186 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.15□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 KIF26BQ2KJY2 2108 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 DOCK7Q96N67 2140 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 AGAP5A6NIR3 686 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 HSPB6O14558 160 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 FGF18O76093 207 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 LARGE1O95461 756 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 NPPBP16860 134 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 GM2AP17900 193 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 TNFSF4P23510 183 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRKCHP24723 683 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCP4P48539 62 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 CLCNKBP51801 687 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 BNC1Q01954 994 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 MYBPHQ13203 477 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZACNQ401N2 412 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 VPS52Q8N1B4 723 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 NEK9Q8TD19 979 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 FAR1Q8WVX9 515 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 UHRF2Q96PU4 802 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 MECRQ9BV79 373 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 Q9N2J8 555 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 SEL1LQ9UBV2 794 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.14□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 ANTXRLA6NF34 631 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC38A8A6NNN8 435 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 PIP5K1BO14986 540 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 DNPH1O43598 174 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 NCK2O43639 380 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 CLDN7O95471 211 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 TYK2P29597 1187 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 MYBPC2Q14324 1141 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 SERPINA11Q86U17 422 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 SECTM1Q8WVN6 248 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 KCNJ9Q92806 393 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 CD101Q93033 1021 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 LHPPQ9H008 270 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 PDE11AQ9HCR9 933 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 NFS1Q9Y697 457 aa3.13□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 SERINC4A6NH21 518 aa3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 FCGR2AP12318 317 aa3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 CKMT1AP12532 417 aa3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 SLC5A1P13866 664 aa3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 PRPH2P23942 346 aa3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 MXI1P50539 228 aa3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 KRTAP10-12P60413 245 aa3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 ST3GAL1Q11201 340 aa3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
PDCL2P1-201ENST00000419302 SYTL3Q4VX76 610 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms