RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 SKIP12755 728 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 CCNCP24863 283 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 MPP3Q13368 585 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 RCN2Q14257 317 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 PPM1JQ5JR12 505 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 TMCO4Q5TGY1 634 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 PDPK2PQ6A1A2 396 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 CMTM5Q96DZ9 223 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 KCNK16Q96T55 309 aa24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 A0A096LPK6 155 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 A6NHS1 94 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP42A6NI28 874 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 SIN3BO75182 1162 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 NFKB1P19838 968 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 CPA2P48052 419 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 CLCNKBP51801 687 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 FSCBQ5H9T9 825 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 KCNMB4Q86W47 210 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 LZTR1Q8N653 840 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 URGCPQ8TCY9 931 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 AGAP3Q96P47 875 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 DONSONQ9NYP3 566 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 IGLV3-25P01717 112 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 SRGAP2BP0DMP2 458 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 ODC1P11926 461 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 COL6A2P12110 1019 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 ABL2P42684 1182 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB17Q13105 803 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 ITGA7Q13683 1181 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 IRGCQ6NXR0 463 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 CES3Q6UWW8 571 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 GAD1Q99259 594 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 SLC7A8Q9UHI5 535 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 DSEQ9UL01 958 aa24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
PMS1-205ENST00000409985 G3V2L1 256 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TRIM13O60858 407 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 LRIG2O94898 1065 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 COL6A1P12109 1028 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 COPAP53621 1224 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 AP2B1P63010 937 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 UPP1Q16831 310 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MAVSQ7Z434 540 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 SLC43A3Q8NBI5 491 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 NETO2Q8NC67 525 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ADAM32Q8TC27 787 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 HAPLN3Q96S86 360 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 GPR22Q99680 433 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 THTPAQ9BU02 230 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 TMEM30AQ9NV96 361 aa24.2■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ZNF623O75123 536 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 HOXC13P31276 330 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 NUMBP49757 651 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 BTKQ06187 659 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ITGA9Q13797 1035 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
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PMS1-205ENST00000409985 UGP2Q16851 508 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ANO4Q32M45 955 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ANO7Q6IWH7 933 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 EPGNQ6UW88 154 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 METTL23Q86XA0 190 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 FBXO27Q8NI29 283 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 NRG4Q8WWG1 115 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 FAM136AQ96C01 138 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CDH19Q9H159 772 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 NMRAL1Q9HBL8 299 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PNPOQ9NVS9 261 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 ARL5CA6NH57 179 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 C2P06681 752 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CACNA2D1P54289 1103 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MXRA7P84157 204 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 KLC1Q07866 573 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CERCAMQ5T4B2 595 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CMC1Q7Z7K0 106 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 CNTN4Q8IWV2 1026 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 PANX3Q96QZ0 392 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 FCRL5Q96RD9 977 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 RHOJQ9H4E5 214 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 STARD7Q9NQZ5 370 aa24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PMS1-205ENST00000409985 A0A088AWK7 358 aa24.18■■□□□ 1.46
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