RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 TPSAB1Q15661 275 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 MPP7Q5T2T1 576 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 CFAP58Q5T655 872 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF783Q6ZMS7 281 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 PDIK1LQ8N165 341 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 SMARCD2Q92925 531 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 FATE1Q969F0 183 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 GLOD4Q9HC38 313 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 NT5MQ9NPB1 228 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 CLEC1BQ9P126 229 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 VPS28Q9UK41 221 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 CDH23Q9H251 3354 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 MAP2K7O14733 419 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 KDELR3O43731 214 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 TBX10O75333 385 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 PEX11BO96011 259 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 GLDCP23378 1020 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 WEE1P30291 646 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 CSKP41240 450 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 MMP13P45452 471 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 FNBP1LQ5T0N5 605 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM25Q86YD3 366 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ASB16Q96NS5 453 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 BBS2Q9BXC9 721 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ACBD3Q9H3P7 528 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 SEMA4AQ9H3S1 761 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF235Q14590 738 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 BBS9Q3SYG4 887 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 FYB2Q5VWT5 728 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 IRF7Q92985 503 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 OTUB2Q96DC9 234 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 FAM161BQ96MY7 647 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 PDFQ9HBH1 243 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 GDE1Q9NZC3 331 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 UBP1Q9NZI7 540 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 MIA3Q5JRA6 1907 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 BANF1O75531 89 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 MAGEA4P43358 317 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 BBS5Q8N3I7 341 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 MCUQ8NE86 351 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 RSPRY1Q96DX4 576 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 C9orf72Q96LT7 481 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF599Q96NL3 588 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 SERPINB12Q96P63 405 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 RUFY1Q96T51 708 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 FEM1AQ9BSK4 669 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 CDH7Q9ULB5 785 aa20.87■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 IFNAR2P48551 515 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 MAXP61244 160 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 CDK16Q00536 496 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ADGRE1Q14246 886 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 SPARCL1Q14515 664 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 LY6G5CQ5SRR4 150 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 DENND2CQ68D51 928 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 FCRL5Q96RD9 977 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 S1PR5Q9H228 398 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 PLAAQ9Y263 795 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 AVILO75366 819 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ANXA9O76027 345 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 ACSL3O95573 720 aa20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
ATG4B-204ENST00000402096 LMAN2Q12907 356 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms