RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF862O60290 1169 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC166P0CW27 439 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 THPOP40225 353 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 UGT2B28Q9BY64 529 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 EBF2Q9HAK2 575 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C2P06681 752 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CCT8P50990 548 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C21orf59P57076 290 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TBX4P57082 545 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC5A9Q2M3M2 681 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SENP8Q96LD8 212 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DPY30Q9C005 99 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ARL2P36404 184 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GTF2A2P52657 109 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ADCY4Q8NFM4 1077 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CSPG4P5Q96PW8 444 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SIN3BO75182 1162 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HOXD13P35453 343 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 IL5RAQ01344 420 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GBE1Q04446 702 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LIN52Q52LA3 116 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 LPCAT4Q643R3 524 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TTC30AQ86WT1 665 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MAB21L3Q8N8X9 362 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 METTL6Q8TCB7 284 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ALG9Q9H6U8 611 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SCNN1BP51168 640 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 EID3Q8N140 333 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC35B2Q8TB61 432 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HASPINQ8TF76 798 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FIG4Q92562 907 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 COPS5Q92905 334 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RHOJQ9H4E5 214 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH22Q9UJ99 828 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 AK5Q9Y6K8 562 aa16.61■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CD48P09326 243 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNB1P14635 433 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC2A4P14672 509 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAJC28Q9NX36 388 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF682O95780 498 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 VAV1P15498 845 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CCNG1P51959 295 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH18Q13634 790 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 EP400NLQ6ZTU2 488 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ACOX2Q99424 681 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GORASP1Q9BQQ3 440 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PARVBQ9HBI1 364 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HLA-DPA1P20036 260 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PKN3Q6P5Z2 889 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 HPS6Q86YV9 775 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 OMDQ99983 421 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MYH8P13535 1937 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MDM4O15151 490 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT6AP02538 564 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT6BP04259 564 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ETS2P15036 469 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PPP3CCP48454 512 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 KRT6CP48668 564 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ATG16L2Q8NAA4 619 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CLEC4DQ8WXI8 215 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 TFAP2BQ92481 460 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SEC14L1Q92503 715 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SERAC1Q96JX3 654 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 ACTR8Q9H981 624 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.6■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 DLGAP3O95886 979 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 RHOCP08134 193 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 MSH3P20585 1137 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 GRM5P41594 1212 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 PRIM2P49643 509 aa16.59■□□□□ 0.25
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC25A52Q3SY17 297 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms