RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.19□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 HEY1Q9Y5J3 304 aa6.19□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CLUHO75153 1309 aa6.19□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 E7EVH7 732 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RASGRF2O14827 1237 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ADAM12O43184 909 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MTSS1O43312 755 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CREB3O43889 395 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CACNG3O60359 315 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 OPHN1O60890 802 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PAGE1O75459 146 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 FAM155BO75949 473 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 METTL18O95568 372 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 C1QAP02745 245 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SLC2A3P11169 496 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MLNP12872 115 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LAG3P18627 525 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ATF6P18850 670 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NR1D1P20393 614 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TARSP26639 723 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CCR1P32246 355 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 FDFT1P37268 417 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PBX3P40426 434 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ARL4CP56559 192 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GPX6P59796 221 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TPI1P60174 286 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 DEFB103AP81534 67 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GAD2Q05329 585 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RING1Q06587 406 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP4Q13115 394 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MTA1Q13330 715 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RAB33AQ14088 237 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PSMD5Q16401 504 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 KRT71Q3SY84 523 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 C5orf22Q49AR2 442 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RASIP1Q5U651 963 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF534Q76KX8 674 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NLRP14Q86W24 1093 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC25Q86WR0 208 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SH2D3CQ8N5H7 860 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LZTR1Q8N653 840 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NPWQ8N729 165 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 FATE1Q969F0 183 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 HDAC11Q96DB2 347 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC39Q96DD0 335 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 P2RY11Q96G91 374 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF558Q96NG5 402 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SERPINB11Q96P15 392 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PGLYRP2Q96PD5 576 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MUC3BQ9H195 1237 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PRDM12Q9H4Q4 367 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IL23AQ9NPF7 189 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GMIPQ9P107 970 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 STK39Q9UEW8 545 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.18□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 DRGXA6NNA5 263 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 B8ZZF3 427 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TM4SF5O14894 197 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SPAG6O75602 509 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SUN1O94901 812 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SEC24AO95486 1093 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ACSL3O95573 720 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IVLP07476 585 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GSTA2P09210 222 aa6.17□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CSF2RAP15509 400 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms