RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 MARK4Q96L34 752 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 TRPV2Q9Y5S1 764 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 LAMB4A4D0S4 1761 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 LDLRP01130 860 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 GSTT1P30711 240 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 PSME3P61289 254 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 JAG1P78504 1218 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC26A9Q7LBE3 791 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 AMIGO3Q86WK7 504 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 FAXDC2Q96IV6 333 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.216e-7■■■■■ 38.2
PTPRN2-201ENST00000389413 RMND5AQ9H871 391 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 CNGB3Q9NQW8 809 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 AHCYL1O43865 530 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 CLCN5P51795 746 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 MAML3Q96JK9 1138 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SERAC1Q96JX3 654 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 OMDQ99983 421 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 PIF1Q9H611 641 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 ALG9Q9H6U8 611 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 RHBDL2Q9NX52 303 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 COPG2Q9UBF2 871 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 XPR1Q9UBH6 696 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 NUDT5Q9UKK9 219 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 MYH10P35580 1976 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 CLDN5O00501 218 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 GCATO75600 419 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 C2P06681 752 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 KLRC2P26717 231 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 PIK3R1P27986 724 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 DAB2P98082 770 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 CYP51A1Q16850 503 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 RINLQ6ZS11 566 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 MICU2Q8IYU8 434 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 LPCAT1Q8NF37 534 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 LMO3Q8TAP4 145 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SEC14L1Q92503 715 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa16.36■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM63AO94886 807 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 MTA1Q13330 715 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SQLEQ14534 574 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 HS6ST3Q8IZP7 471 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 GANCQ8TET4 914 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 BHMTQ93088 406 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 RCN3Q96D15 328 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 PDZD7Q9H5P4 517 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 COMMD8Q9NX08 183 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 EGFRP00533 1210 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 S100A5P33763 92 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 ADRA1BP35368 520 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 PTPN9P43378 593 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC18A1P54219 525 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 OR56A4Q8NGH8 313 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 C5orf58C9J3I9 102 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 DPYSL4O14531 572 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 YWHAQP27348 245 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SCNN1GP51170 649 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 FCGRTP55899 365 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 RHOAP61586 193 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 XIAPP98170 497 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 NRF1Q16656 503 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 CD101Q93033 1021 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 VPS33AQ96AX1 596 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 FBXO5Q9UKT4 447 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 COL1A2P08123 1366 aa16.35■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC154A6NI56 674 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 TRIM38O00635 465 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 ASPAP45381 313 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 CTBP1Q13363 440 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC39A4Q6P5W5 647 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 PPTC7Q8NI37 304 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 C10orf82Q8WW14 230 aa16.34■□□□□ 0.21
PTPRN2-201ENST00000389413 RTKNQ9BST9 563 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms