RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PRKAA2P54646 552 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ACTR2P61160 394 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GRM1Q13255 1194 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 APOFQ13790 326 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 LPIN1Q14693 890 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NADK2Q4G0N4 442 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FAXCQ5TGI0 409 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FAM160B1Q5W0V3 765 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FIGNL1Q6PIW4 674 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM270Q6UE05 265 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 RFX8Q6ZV50 586 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF410Q86VK4 478 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 BBS5Q8N3I7 341 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PPM1NQ8N819 430 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 HM13Q8TCT9 377 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF606Q8WXB4 792 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TOP1MTQ969P6 601 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MCEEQ96PE7 176 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 NAT9Q9BTE0 207 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 SMYD3Q9H7B4 428 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 PALMDQ9NP74 551 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.34□□□□□ -1.23
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC162PA2VCL2 907 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TISP43B9A030 160 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MATN2O00339 956 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJA2O60884 412 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6V1G1O75348 118 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RFPL1O75677 317 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 USP1O94782 785 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM63AO94886 807 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K6O95382 1288 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PGM3O95394 542 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CCNE2O96020 404 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PROCP04070 461 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HOXC6P09630 235 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RBP3P10745 1247 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CPB1P15086 417 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PORP16435 677 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF12P17014 697 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KDELR1P24390 212 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 GRIA2P42262 883 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC1A6P48664 564 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LIG4P49917 911 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SLC26A2P50443 739 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF132P52740 706 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EPHB1P54762 984 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PHEXP78562 749 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ADGRE1Q14246 886 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KCNJ11Q14654 390 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SURF1Q15526 300 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC153Q494R4 210 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 XKR9Q5GH70 373 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD22Q5VYY1 191 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 LPCAT4Q643R3 524 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ARMCX2Q7L311 632 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DEFB107AQ8IZN7 70 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TRIML2Q8N7C3 387 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SMYD1Q8NB12 490 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 KCTD6Q8NC69 237 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA18Q8TC71 538 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 BSNDQ8WZ55 320 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 FAF2Q96CS3 445 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 RTP4Q96DX8 246 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 SGF29Q96ES7 293 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 OSBPL11Q9BXB4 747 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 C8orf4Q9NR00 106 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 HSFX1Q9UBD0 423 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CPA4Q9UI42 421 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.34□□□□□ -1.24
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0B4J269 797 aa7.33□□□□□ -1.24
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