RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 EPS15L1Q9UBC2 864 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 KDELR3O43731 214 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ADH5P11766 374 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 CD70P32970 193 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PDGFRLQ15198 375 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 MTSS1LQ765P7 747 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 MAML1Q92585 1016 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 DYNC1I1O14576 645 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 METTL18O95568 372 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PEX11BO96011 259 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PSMC3P17980 439 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 RENBPP51606 427 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 BRD3Q15059 726 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 MARC1Q5VT66 337 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PCGF5Q86SE9 256 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 NAT16Q8N8M0 369 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ART4Q93070 314 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FATE1Q969F0 183 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 IL12RB2Q99665 862 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ERLIN1O75477 346 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ECHS1P30084 290 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 GAD2Q05329 585 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PPIL6Q8IXY8 311 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 CPT1BQ92523 772 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TEKT5Q96M29 485 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PDFQ9HBH1 243 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ETNK1Q9HBU6 452 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC151A5D8V7 595 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 E7EVH7 732 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 NDC80O14777 642 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 SNAP91O60641 907 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ECI2O75521 394 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PSMB4P28070 264 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 CAV1Q03135 178 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TNK2Q07912 1038 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 APCDD1Q8J025 514 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 CNTD1Q8N815 330 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FMO2Q99518 471 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 HLA-DQB2P05538 268 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 NFKB1P19838 968 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 HLA-FP30511 346 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FDFT1P37268 417 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 MMP13P45452 471 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TFF2Q03403 129 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 MORF4L2Q15014 288 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PARP6Q2NL67 630 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 MAP9Q49MG5 647 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ALG14Q96F25 216 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF599Q96NL3 588 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 GBA3Q9H227 469 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 NT5MQ9NPB1 228 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXA4-201ENST00000360046 VPS51Q9UID3 782 aa22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms