RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359785.9

PTPN22-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN22, Length 3,654 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22-201ENST00000359785 TYK2P29597 1187 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ARRB2P32121 409 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 S100A5P33763 92 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 MAGEA2P43356 314 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 JAK3P52333 1124 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 TNFAIP2Q03169 654 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 NCOA4Q13772 614 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 KEAP1Q14145 624 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 E2F2Q14209 437 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 DPYSL2Q16555 572 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 PDPK2PQ6A1A2 396 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 AADACL2Q6P093 401 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 BEND5Q7L4P6 421 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 GSTCDQ8NEC7 633 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 RASGRP4Q8TDF6 673 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 STYXQ8WUJ0 223 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 CASP10Q92851 521 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 TSGA13Q96PP4 275 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 WDR18Q9BV38 432 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 BRINP2Q9C0B6 783 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 KIAA1257Q9ULG3 409 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ITM2BQ9Y287 266 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 TLL2Q9Y6L7 1015 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 A0A075B6Q4 140 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 KRBA1A5PL33 1030 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF839A8K0R7 811 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 H3BRJ5 948 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 GRID2O43424 1007 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 SPOPO43791 374 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 CABYRO75952 493 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 USP1O94782 785 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 PGAM1P18669 254 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 OSBPP22059 807 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 CAPGP40121 348 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ADCY8P40145 1251 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 GPD2P43304 727 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 LIMK2P53671 638 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 RAD51Q06609 339 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 SCAPQ12770 1279 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 SELENBP1Q13228 472 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 FAM187BQ17R55 369 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 CYBRD1Q53TN4 286 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 TCERG1LQ5VWI1 586 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 GPR141Q7Z602 305 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 TTC7BQ86TV6 843 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 CAMK1DQ8IU85 385 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 SIAH1Q8IUQ4 282 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 NT5C3BQ969T7 300 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 TADA1Q96BN2 335 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 NRBF2Q96F24 287 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 CEP170P1Q96L14 293 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 MARK4Q96L34 752 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ZBTB3Q9H5J0 574 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 LIN7BQ9HAP6 207 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 TMEM260Q9NX78 707 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 ANAPC7Q9UJX3 599 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPN22-201ENST00000359785 UPK1AO00322 258 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 TIMM44O43615 452 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ZBTB14O43829 449 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 GAS2O43903 313 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 KLK8O60259 260 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 PFDN1O60925 122 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 TBCAO75347 108 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ATE1O95260 518 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 VNN1O95497 513 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 TSPAN12O95859 305 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 MT-ND3P03897 115 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 SBK3P0C264 359 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 ODC1P11926 461 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 JAK1P23458 1154 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 HTR1EP28566 365 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPN22-201ENST00000359785 BMPR1AP36894 532 aa4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms