RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 LIMK2P53671 638 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 DAOAP59103 153 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC01599Q8WXQ3 324 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXW11Q9UKB1 542 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 NCAM2O15394 837 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 USP1O94782 785 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO21O94952 628 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MYL4P12829 197 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK7P50613 346 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 FSTL4Q6MZW2 842 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 STRA8Q7Z7C7 330 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 IFT43Q96FT9 208 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 GPAMQ9HCL2 828 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 BFARQ9NZS9 450 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 SCOCQ9UIL1 159 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 GIT1Q9Y2X7 761 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 SHROOM3Q8TF72 1996 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINB8P50452 374 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ITGA9Q13797 1035 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 NPWQ8N729 165 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 AGAP2Q99490 1192 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 STARD7Q9NQZ5 370 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MEI4A8MW99 385 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 FESP07332 822 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 CD68P34810 354 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 TPI1P60174 286 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 CHST12Q9NRB3 414 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 C5orf42Q9H799 3197 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PQY0 241 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 E2F8A0AVK6 867 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 SOAT2O75908 522 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1G1P47890 313 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 TMCO4Q5TGY1 634 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf146Q5VVC0 180 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 AZIN2Q96A70 460 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 GBA3Q9H227 469 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ENO4A6NNW6 628 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ARPP19P56211 112 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 AP2B1P63010 937 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A3Q00325 362 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 DSC3Q14574 896 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 CLLU1OSQ5K130 101 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 LHX8Q68G74 356 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 CLEC14AQ86T13 490 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 TNS4Q8IZW8 715 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 BRD8Q9H0E9 1235 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 DDIT4Q9NX09 232 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 BPTFQ12830 3046 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEA13PA6NCF6 341 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K13O43283 966 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR15P49685 360 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 GSTA3Q16772 222 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB41Q5JT25 222 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 POU5F2Q8N7G0 328 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAAF3Q8N9W5 541 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 HDAC11Q96DB2 347 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MCMBPQ9BTE3 642 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 CNGB3Q9NQW8 809 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 G3V2L1 256 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 AHCYL1O43865 530 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MPOP05164 745 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 COPAP53621 1224 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 CERCAMQ5T4B2 595 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MFSD3Q96ES6 412 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 TRHDEQ9UKU6 1024 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MTSS1O43312 755 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 VEGFBP49765 207 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNT2Q10471 571 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB17Q13105 803 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 PDPK2PQ6A1A2 396 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 OVOS1Q6IE37 1185 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 SCN4BQ8IWT1 228 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC9BQ8N6N2 239 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 SHKBP1Q8TBC3 707 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A096LPK6 155 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEB16A2A368 324 aa19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 F7P08709 466 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
SH3BP1-201ENST00000357436 NPY2RP49146 381 aa19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms