RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 UQCRBP14927 111 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ERCC2P18074 760 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 SSTR1P30872 391 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 HCAR3P49019 387 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 TPI1P60174 286 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 OVGP1Q12889 678 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 CBLBQ13191 982 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 KLC3Q6P597 504 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ULK2Q8IYT8 1036 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 SCLYQ96I15 445 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 APOPT1Q96IL0 206 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 C7orf26Q96N11 449 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 RNF208Q9H0X6 261 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 MARCH5Q9NX47 278 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 HCSTQ9UBK5 93 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 CHMP2BQ9UQN3 213 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 SNX10Q9Y5X0 201 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ETV4P43268 484 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 SLC11A1P49279 550 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 SLC18A2Q05940 514 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 FAM171A1Q5VUB5 890 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 SCD5Q86SK9 330 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 IGDCC3Q8IVU1 814 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 JADE3Q92613 823 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 BTBD9Q96Q07 612 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PANX3Q96QZ0 392 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PAFAH2Q99487 392 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 WWP1Q9H0M0 922 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ABCC13Q9NSE7 274 aa19■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 A0A0A0MRY4 1105 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 MYL2P10916 166 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ELK3P41970 407 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 GPR15P49685 360 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PGFP49763 221 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PDK1Q15118 436 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 NPAS4Q8IUM7 802 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PALM2Q8IXS6 379 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 CRIPAKQ8N1N5 446 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA13Q96N96 652 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 GPR62Q9BZJ7 368 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 TEX264Q9Y6I9 313 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 VWA8A3KMH1 1905 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PEX1O43933 1283 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 LPXNO60711 386 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 AVILO75366 819 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ALDH2P05091 517 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 APRTP07741 180 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ITGA2BP08514 1039 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 TPSB2P20231 275 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 GLUD2P49448 558 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 TPSAB1Q15661 275 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 TP53INP2Q8IXH6 220 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 MCUQ8NE86 351 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 RNF34Q969K3 372 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 MTBPQ96DY7 904 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 P2RY11Q96G91 374 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 C8orf48Q96LL4 319 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 OCEL1Q9H607 264 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PREBQ9HCU5 417 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PLK2Q9NYY3 685 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 TET1Q8NFU7 2136 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 IRAK2O43187 625 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 HOXA2O43364 376 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 FGFR3P22607 806 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 CCL23P55773 120 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 DDR2Q16832 855 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP157Q5JU67 520 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF280DQ6N043 979 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 RASSF3Q86WH2 238 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 B3GALT6Q96L58 329 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 CATSPER2Q96P56 530 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS1-204ENST00000352260 SIKE1Q9BRV8 207 aa18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms