RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348333.7

TNFRSF25-201, Transcript of TNF receptor superfamily member 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNFRSF25, Length 1,119 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25-201ENST00000348333 FTH1P19P0C7X4 201 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 SDC4P31431 198 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 NSFP46459 744 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCR5P51681 352 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 HDAC4P56524 1084 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAS2R38P59533 333 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT83P78385 493 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 C6orf118Q5T5N4 469 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 MANEALQ5VSG8 457 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 MON1BQ7L1V2 547 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 GATA6Q92908 595 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 SPON2Q9BUD6 331 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZYG11BQ9C0D3 744 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa23.27■■□□□ 1.32
TNFRSF25-201ENST00000348333 ASPMQ8IZT6 3477 aa23.27■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3EA0A087X179 549 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 A0A1W2PR77 199 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3LB9A6J9 549 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 CBX4O00257 560 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 VILLO15195 856 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ALOX15BO15296 676 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3HP0C7X1 549 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ADRA1BP35368 520 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACVRL1P37023 503 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 PTPN9P43378 593 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 GSCP56915 257 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARF5P84085 180 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 C22orf39Q6P5X5 142 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 DBX2Q6ZNG2 339 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 DSG4Q86SJ6 1040 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLCO6A1Q86UG4 719 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARRDC3Q96B67 414 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 AGPAT1Q99943 283 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.26■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ILVBLA1L0T0 632 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 LATO43561 262 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 KRT3P12035 628 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 WDR59Q6PJI9 974 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 SERAC1Q96JX3 654 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TOR4AQ9NXH8 423 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 OR12D3Q9UGF7 316 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa23.25■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD160O95971 181 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 PROS1P07225 676 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 GPD1P21695 349 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 CHRNA3P32297 505 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 C21orf59P57076 290 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 GNA12Q03113 381 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 SHBQ15464 509 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 FAM46CQ5VWP2 391 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 STRADAQ7RTN6 431 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 NLRP14Q86W24 1093 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 PYROXD2Q8N2H3 581 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 C3orf20Q8ND61 904 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 BAP1Q92560 729 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 SELENOOQ9BVL4 669 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATP13A1Q9HD20 1204 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 CA5BQ9Y2D0 317 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa23.24■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 FLRT2O43155 660 aa23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 SLC7A4O43246 635 aa23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCP110O43303 1012 aa23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 LRIG2O94898 1065 aa23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 CD38P28907 300 aa23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 CCT8P50990 548 aa23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TNFRSF25-201ENST00000348333 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms