RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 CDRT15Q96T59 188 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 STK39Q9UEW8 545 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 SIK3Q9Y2K2 1263 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 NRCAMQ92823 1304 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 STX4Q12846 297 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 ITFG1Q8TB96 612 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 NDNQ99608 321 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 IDI2Q9BXS1 227 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 NPR3P17342 541 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 HECTD3Q5T447 861 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 EPN2O95208 641 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 PKNOX1P55347 436 aa22.68■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 GJB1P08034 283 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF844Q08AG5 666 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 ADRM1Q16186 407 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 VPS4BO75351 444 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 BANF1O75531 89 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.68■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 PTGES3LE9PB15 166 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 IRF6O14896 467 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 CAPN15O75808 1086 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 PIGNO95427 931 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 HDCP19113 662 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 ACSM2AQ08AH3 577 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 ACSM2BQ68CK6 577 aa22.67■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 LRRN4CLQ8ND94 238 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 USP32Q8NFA0 1604 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 NEK3P51956 506 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 GPR42O15529 346 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 HNF4AP41235 474 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 FBXO30Q8TB52 745 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 CCDC149Q6ZUS6 474 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 ACTRT2Q8TDY3 377 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRM-201ENST00000332175 HK2P52789 917 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 C16orf72Q14CZ0 275 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 MOB2Q70IA6 237 aa22.66■■□□□ 1.22
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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