RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 OR52B2Q96RD2 323 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 HPS4Q9NQG7 708 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PSME2Q9UL46 239 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ILVBLA1L0T0 632 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 KRBA1A5PL33 1030 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 HMGCRP04035 888 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ECT2LQ008S8 904 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 RUNX1T1Q06455 604 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 GRTP1Q5TC63 336 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PRR23CQ6ZRP0 262 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TTC30BQ8N4P2 665 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PHF21BQ96EK2 531 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 CISHQ9NSE2 258 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 PITRM1Q5JRX3 1037 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 FAM162AQ96A26 154 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 KLHL32Q96NJ5 620 aa16.86■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 KCNH7Q9NS40 1196 aa16.86■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 EVPLLA8MZ36 301 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 BMXP51813 675 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 GPR180Q86V85 440 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 MASTLQ96GX5 879 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 POLE4Q9NR33 117 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SNX15Q9NRS6 342 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 NDUFAF1Q9Y375 327 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 A8MU76 341 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
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PACS1-201ENST00000320580 TCF4P15884 667 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TUBA1BP68363 451 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 GRM2Q14416 872 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TUBA1AQ71U36 451 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CLIP4Q8N3C7 705 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 MKL1Q969V6 931 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PTPRHQ9HD43 1115 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 HSFX1Q9UBD0 423 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TFECO14948 347 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ATP6AP2O75787 350 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PCNAP12004 261 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 RARRES1P49788 294 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 RAB39AQ14964 217 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TTC23Q5W5X9 447 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 BEST2Q8NFU1 509 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 OR2T34Q8NGX1 318 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 OR2T3Q8NH03 318 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SLIT2O94813 1529 aa16.85■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 BORAQ6PGQ7 559 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 AMIGO3Q86WK7 504 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TPK1Q9H3S4 243 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CAPN14A8MX76 684 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 HSMCR30P0CW71 290 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 MON1BQ7L1V2 547 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 RDM1Q8NG50 284 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CPNE1Q99829 537 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 FBXO21O94952 628 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 SMIM18P0DKX4 95 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 C11orf74Q86VG3 221 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 RMDN3Q96TC7 470 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 OMDQ99983 421 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.84■□□□□ 0.29
PACS1-201ENST00000320580 TBC1D13Q9NVG8 400 aa16.84■□□□□ 0.29
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