RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SPOCK2Q92563 424 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 APOPT1Q96IL0 206 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 TBL1YQ9BQ87 522 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 SP110Q9HB58 689 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 CHRAC1Q9NRG0 131 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 PSAT1Q9Y617 370 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 ZBBXA8MT70 800 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 BAIAP3O94812 1187 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 ELF1P32519 619 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 LBX1P52954 281 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
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VSTM4-201ENST00000298454 DENND1CQ8IV53 801 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 FICDQ9BVA6 458 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 IL22Q9GZX6 179 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 FAM169AQ9Y6X4 670 aa23.17■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 TM9SF1O15321 606 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 TEX28O15482 410 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 PMPCBO75439 489 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 USP1O94782 785 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 KLKB1P03952 638 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA31D3P0C874 917 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 ACVRL1P37023 503 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 RENBPP51606 427 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 NEK3P51956 506 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 MAXP61244 160 aa23.16■■□□□ 1.3
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VSTM4-201ENST00000298454 MTA1Q13330 715 aa23.16■■□□□ 1.3
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VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 PACS1Q6VY07 963 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 RASSF3Q86WH2 238 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 NT5MQ9NPB1 228 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 IL23AQ9NPF7 189 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 CA8P35219 290 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINB9P50453 376 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 GEMP55040 296 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 MARC1Q5VT66 337 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 KDELC2Q7Z4H8 507 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 MTBPQ96DY7 904 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 ZFATQ9P243 1243 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.16■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 STC2O76061 302 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 FGF18O76093 207 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 SLC11A2P49281 568 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 IFT88Q13099 833 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 PDK4Q16654 411 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 DENND5AQ6IQ26 1287 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 C6orf89Q6UWU4 347 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 CABS1Q96KC9 395 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF778Q96MU6 729 aa23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa23.14■■□□□ 1.3
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VSTM4-201ENST00000298454 LILRB3O75022 631 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 IRF1P10914 325 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 ADRA1AP35348 466 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 PPM1AP35813 382 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 MAPKAPK2P49137 400 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC3Q13217 504 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 SERINC3Q13530 473 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 PARP15Q460N3 678 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 C5orf22Q49AR2 442 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.14■■□□□ 1.3
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VSTM4-201ENST00000298454 TCEAL8Q8IYN2 117 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 FATE1Q969F0 183 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 WBP2Q969T9 261 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 MRGPRX2Q96LB1 330 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 ATXN3LQ9H3M9 355 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 GGA2Q9UJY4 613 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 SOX13Q9UN79 622 aa23.14■■□□□ 1.3
VSTM4-201ENST00000298454 WDR91A4D1P6 747 aa23.14■■□□□ 1.29
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VSTM4-201ENST00000298454 ITKQ08881 620 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PLD4Q96BZ4 506 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 FAM111AQ96PZ2 611 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 FSD1LQ9BXM9 530 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SLC25A51Q9H1U9 297 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 PTPRSQ13332 1948 aa23.14■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 COPEO14579 308 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 SNX3O60493 162 aa23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 F7P08709 466 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00271P0C7V0 271 aa23.13■■□□□ 1.29
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