RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 CROTQ9UKG9 612 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RGS14O43566 566 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ETS1P14921 441 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ABL2P42684 1182 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TRAF2Q12933 501 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SLC24A5Q71RS6 500 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PIK3R5Q8WYR1 880 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MAF1Q9H063 256 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CASZ1Q86V15 1759 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 OPLAHO14841 1288 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ANXA5P08758 320 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CDC25CP30307 473 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BBS12Q6ZW61 710 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RIN3Q8TB24 985 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 VMP1Q96GC9 406 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SIKE1Q9BRV8 207 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 MRC1P22897 1456 aa20.53■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 TCF3P15923 654 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BAP1Q92560 729 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RAB21Q9UL25 225 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 B4GALT4O60513 344 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 LAG3P18627 525 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GPR1P46091 355 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 SCTRP47872 440 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GLUD2P49448 558 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RAD23AP54725 363 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CRYMQ14894 314 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 CDK20Q8IZL9 346 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 GABRR2P28476 465 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NDUFV1P49821 464 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 BTBD7Q9P203 1132 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NDUFS2O75306 463 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 PGM2Q96G03 612 aa20.52■□□□□ 0.88
USP25-202ENST00000285681 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.52■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 UBOX5O94941 541 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 IL1BP01584 269 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ASGR1P07306 291 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 IRF8Q02556 426 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 BRMS1LQ5PSV4 323 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ALLCQ8N6M5 410 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CCDC154A6NI56 674 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ATP6V1B1P15313 513 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ABCG1P45844 678 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CCDC142Q17RM4 750 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 STARD8Q92502 1023 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CERS2Q96G23 380 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ANKDD1BA6NHY2 528 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TTPAP49638 278 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CRADDP78560 199 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 IL27RAQ6UWB1 636 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 FIG4Q92562 907 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 FCHO1O14526 889 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 KPNA5O15131 536 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 KCNA10Q16322 511 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 GPR152Q8TDT2 470 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CAPNS2Q96L46 248 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 PADI3Q9ULW8 664 aa20.51■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TPP1O14773 563 aa20.5■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TREHO43280 583 aa20.5■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 GUCY1B2O75343 617 aa20.5■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 CORO7P57737 925 aa20.5■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.5■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.5■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 QRFPRQ96P65 431 aa20.5■□□□□ 0.87
USP25-202ENST00000285681 ALG9Q9H6U8 611 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms