RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 PIK3R1P27986 724 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 IYDQ6PHW0 289 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 TMEM40Q8WWA1 233 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 OLFM3Q96PB7 478 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 SORT1Q99523 831 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 GPAMQ9HCL2 828 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 COL1A2P08123 1366 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 KLHL33A6NCF5 533 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ALDH1A2O94788 518 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 DDHD2O94830 711 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 MYL4P12829 197 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 MFSD10Q14728 455 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 CNPY1Q3B7I2 92 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 RNF111Q6ZNA4 994 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 IL22Q9GZX6 179 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 XPR1Q9UBH6 696 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 AK5Q9Y6K8 562 aa18.76■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 NRCAMQ92823 1304 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 HDAC3O15379 428 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 COG7P83436 770 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB17Q13105 803 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 GPR142Q7Z601 462 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ACVR1CQ8NER5 493 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 MAPK15Q8TD08 544 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PHF21BQ96EK2 531 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 NCAM2O15394 837 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB14O43829 449 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 LRIG2O94898 1065 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 TFEBP19484 476 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 CYP2B6P20813 491 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 SFT2D3Q587I9 215 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 SH2D4BQ5SQS7 431 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 STEAP4Q687X5 459 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ZNF470Q6ECI4 717 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 NPY6RQ99463 290 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 C1orf21Q9H246 121 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PIRO00625 290 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 SLC4A1P02730 911 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 NPY2RP49146 381 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 MPP1Q00013 466 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 AAGABQ6PD74 315 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 METTL23Q86XA0 190 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 APPL1Q9UKG1 709 aa18.75■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 STRNO43815 780 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 GSTA3Q16772 222 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 TMCO4Q5TGY1 634 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 MAVSQ7Z434 540 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PCED1BQ96HM7 432 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 MAGEB16A2A368 324 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 BTBD8Q5XKL5 378 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 TLK2Q86UE8 772 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 FAM35AQ86V20 835 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 NDNQ99608 321 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ADAM28Q9UKQ2 775 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ANKRD33BA6NCL7 494 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 VCLP18206 1134 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ALDH1A3P47895 512 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 DLG1Q12959 904 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PRKAA1Q13131 559 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 LAMB3Q13751 1172 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 CYTH1Q15438 398 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 UGP2Q16851 508 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ZNF792Q3KQV3 632 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 NPWQ8N729 165 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PAF1Q8N7H5 531 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 GORASP1Q9BQQ3 440 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 FBXO21O94952 628 aa18.73■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 THP07101 528 aa18.73■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 PAMP19021 973 aa18.73■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 BTKQ06187 659 aa18.73■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 SLC12A1Q13621 1099 aa18.73■□□□□ 0.59
LRP3-201ENST00000253193 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms