RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246891.8

CSN1S1-201, Transcript of casein alpha s1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSN1S1, Length 985 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC5A1P13866 664 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 PRKAR2BP31323 418 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 COBLL1Q53SF7 1204 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 GORABQ5T7V8 394 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 PARM1Q6UWI2 310 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 SARGQ9BW04 601 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 NFU1Q9UMS0 254 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 ICKQ9UPZ9 632 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 FAM50BQ9Y247 325 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 DTNAQ9Y4J8 743 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 CEP83Q9Y592 693 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 MAP3K19Q56UN5 1328 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 ALS2Q96Q42 1657 aa4.85□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 COL18A1P39060 1754 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 NFAT5O94916 1531 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 C1orf167Q5SNV9 1468 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 FOXO6A8MYZ6 492 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 PODXLO00592 558 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 NKX2-8O15522 239 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 FGF18O76093 207 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF853P0CG23 659 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 MT3P25713 68 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 ENTPD1P49961 510 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 RIPK4P57078 832 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 TLE3Q04726 772 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 PMS2P11Q13670 270 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 C10orf76Q5T2E6 689 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC22A17Q8WUG5 538 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF566Q969W8 418 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 MED30Q96HR3 178 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 C8orf48Q96LL4 319 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 TBCBQ99426 244 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 TM7SF3Q9NS93 570 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 TNNQ9UQP3 1299 aa4.84□□□□□ -1.63
CSN1S1-201ENST00000246891 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 MST1RQ04912 1400 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 SBNO1A3KN83 1393 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 TMEM94Q12767 1356 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 IL16Q14005 1332 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 PRC1O43663 620 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 TAF5LO75529 589 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 RASSF2P50749 326 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 RARSP54136 660 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 GALNT3Q14435 633 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 Q5PR19 223 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 ERAP2Q6P179 960 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 ELP5Q8TE02 316 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 MORC4Q8TE76 937 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 OIT3Q8WWZ8 545 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 FSCN3Q9NQT6 498 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 MYO6Q9UM54 1294 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 KIF1AQ12756 1690 aa4.83□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 SLIT3O75094 1523 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 FANCIQ9NVI1 1328 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 MSI1O43347 362 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 KRT86O43790 486 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 NTSR2O95665 410 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 HOXC6P09630 235 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 IGFBP2P18065 325 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 HOXC9P31274 260 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 LTBQ06643 244 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 PMPCAQ10713 525 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 DCTN1Q14203 1278 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 KRT81Q14533 505 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 AAK1Q2M2I8 961 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 ALG10Q5BKT4 473 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 FAM209BQ5JX69 171 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.82□□□□□ -1.64
CSN1S1-201ENST00000246891 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms