RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 IGSF8Q969P0 613 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 AGAP3Q96P47 875 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CEP41Q9BYV8 373 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NDFIP2Q9NV92 336 aa9.73□□□□□ -0.85
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APOBEC1-201ENST00000229304 F5H5T6 163 aa9.72□□□□□ -0.85
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APOBEC1-201ENST00000229304 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LGSNQ5TDP6 509 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CAPN12Q6ZSI9 719 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC149Q6ZUS6 474 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CHST9Q7L1S5 443 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM150AQ86TG1 271 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.72□□□□□ -0.85
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APOBEC1-201ENST00000229304 CFAP36Q96G28 342 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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APOBEC1-201ENST00000229304 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa9.72□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NACA2Q9H009 215 aa9.72□□□□□ -0.85
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APOBEC1-201ENST00000229304 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
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APOBEC1-201ENST00000229304 H3BNC9 293 aa9.71□□□□□ -0.86
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APOBEC1-201ENST00000229304 KRT37O76014 449 aa9.71□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 STC2O76061 302 aa9.71□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM107AO95990 144 aa9.71□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 POLBP06746 335 aa9.71□□□□□ -0.86
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APOBEC1-201ENST00000229304 CNTFP26441 200 aa9.71□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 MGAT1P26572 445 aa9.71□□□□□ -0.86
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APOBEC1-201ENST00000229304 CDH17Q12864 832 aa9.71□□□□□ -0.86
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APOBEC1-201ENST00000229304 MPP3Q13368 585 aa9.71□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 MTM1Q13496 603 aa9.71□□□□□ -0.86
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APOBEC1-201ENST00000229304 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM135Q86UB9 458 aa9.71□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.71□□□□□ -0.86
APOBEC1-201ENST00000229304 OR52K1Q8NGK4 314 aa9.71□□□□□ -0.86
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