RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	VILL	O15195	856 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CILP	O75339	1184 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	MMP3	P08254	477 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SMIM18	P0DKX4	95 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TSHR	P16473	764 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	RGS2	P41220	211 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	KY	Q8NBH2	561 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	C1orf21	Q9H246	121 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SNTG2	Q9NY99	539 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	DTL	Q9NZJ0	730 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482		C9JVG2	144 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	MFSD11	O43934	449 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC130	P13994	396 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ARL4A	P40617	200 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PLK1	P53350	603 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	AP3M2	P53677	418 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TNFAIP2	Q03169	654 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	LILRA2	Q8N149	483 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	HAPLN3	Q96S86	360 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TMCC1	O94876	653 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TSPAN8	P19075	237 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CEACAM7	Q14002	265 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SERPINI1	Q99574	410 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	WDR41	Q9HAD4	459 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	GJD2	Q9UKL4	321 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TFPT	P0C1Z6	253 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	MTTP	P55157	894 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	DCAF6	Q58WW2	860 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	GK5	Q6ZS86	529 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	KBTBD6	Q86V97	674 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TTC30A	Q86WT1	665 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PPTC7	Q8NI37	304 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CIB1	Q99828	191 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CDH19	Q9H159	772 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF39	Q9H2S5	420 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TREH	O43280	583 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	MYL3	P08590	195 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	VDR	P11473	427 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TGM2	P21980	687 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	GRK2	P25098	689 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PDK2	Q15119	407 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TAZ	Q16635	292 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	CERS2	Q96G23	380 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	P2RY11	Q96G91	374 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-222	ENST00000639482	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms