RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 ALG14Q96F25 216 aa21.44■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 MED15Q96RN5 788 aa21.44■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.023e-7■■■■■ 29.6
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa21.44■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 CLCA2Q9UQC9 943 aa21.44■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 RRP8O43159 456 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 MED7O43513 233 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SIGLEC6O43699 453 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRLRP16471 622 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF18P17022 549 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 BMP6P22004 513 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 STX17P56962 302 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 TAS2R38P59533 333 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 DLG2Q15700 870 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 GJB7Q6PEY0 223 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 IQCHQ86VS3 1027 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 DEFB106AQ8N104 65 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC39A7Q92504 469 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 BAP1Q92560 729 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 FEM1AQ9BSK4 669 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 VANGL2Q9ULK5 521 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 DMTF1Q9Y222 760 aa21.43■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 ATP9BO43861 1147 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCR1P32246 355 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 CDK17Q00537 523 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC173Q0VFZ6 552 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 ILKQ13418 452 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 PASD1Q8IV76 773 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 CPXM1Q96SM3 734 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 FZD3Q9NPG1 666 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 UCKL1Q9NWZ5 548 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 VPS28Q9UK41 221 aa21.42■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 BIN1O00499 593 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC31A1O15431 190 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 FFAR2O15552 330 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 MAGEC1O60732 1142 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 CTSLP07711 333 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 ACP1P24666 158 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 PPP1R2P41236 205 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 C19orf57Q0VDD7 668 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 NME3Q13232 169 aa21.41■■□□□ 1.02
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VIM-AS1-202ENST00000605833 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 C14orf80Q86SX3 495 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC25A45Q8N413 288 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 RFFLQ8WZ73 363 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 OR51B4Q9Y5P0 310 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 MGAQ8IWI9 3026 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 CFAP46Q8IYW2 2715 aa21.41■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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VIM-AS1-202ENST00000605833 ALOX15BO15296 676 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 THEGLP0DJG4 465 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC2A3P11169 496 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 NUDT1P36639 197 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 USP8P40818 1118 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 OXCT1P55809 520 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 DAB2P98082 770 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 APBA1Q02410 837 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 OVGP1Q12889 678 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 ERICH1Q86X53 443 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 WDTC1Q8N5D0 677 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM145Q8NBT3 493 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 FGF11Q92914 225 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 PREBQ9HCU5 417 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.4■■□□□ 1.02
VIM-AS1-202ENST00000605833 A0A1W2PQU0 124 aa21.39■■□□□ 1.01
VIM-AS1-202ENST00000605833 BICDL2A1A5D9 508 aa21.39■■□□□ 1.01
VIM-AS1-202ENST00000605833 BECN2A8MW95 431 aa21.39■■□□□ 1.01
VIM-AS1-202ENST00000605833 RNF103O00237 685 aa21.39■■□□□ 1.01
VIM-AS1-202ENST00000605833 SNAP91O60641 907 aa21.39■■□□□ 1.01
VIM-AS1-202ENST00000605833 MT-CO1P00395 513 aa21.39■■□□□ 1.01
VIM-AS1-202ENST00000605833 SRCP12931 536 aa21.39■■□□□ 1.01
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