RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHA7Q9UN72 937 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa22.41■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 F5H5T6 163 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 M0QYV0 167 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDH8O95206 1070 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 CLN3Q13286 438 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 Q6ZVU0 165 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 FRS2Q8WU20 508 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 DYRK4Q9NR20 520 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA1257Q9ULG3 409 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 SSUH2Q9Y2M2 353 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa22.4■■□□□ 1.18
CAPNS1-205ENST00000588780 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 H3BM21 787 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXO21O94952 628 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 GJB6O95452 261 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 LRMPQ12912 555 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 DLG2Q15700 870 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 NFIL3Q16649 462 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 OR6B2Q6IFH4 312 aa22.39■■□□□ 1.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 Q6ZSR6 202 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 HORMAD1Q86X24 394 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 NOX5Q96PH1 765 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 U3KQA8 63 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 TAS2R38P59533 333 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 LCLAT1Q6UWP7 414 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 IFT43Q96FT9 208 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 A6NNZ2 444 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 CDRT15L2A8MXV6 281 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 MCF2LO15068 1137 aa22.37■■□□□ 1.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 OXCT1P55809 520 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 SKOR1P84550 965 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 NNTQ13423 1086 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF284Q2VY69 593 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 NEK5Q6P3R8 708 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 TAC4Q86UU9 113 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 JAMLQ86YT9 394 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 EXTL1Q92935 676 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC39A13Q96H72 371 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ST7Q9NRC1 585 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa22.37■■□□□ 1.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 NR0B2Q15466 257 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 RABGAP1LQ5R372 815 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM270Q6UE05 265 aa22.36■■□□□ 1.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa22.36■■□□□ 1.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
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CAPNS1-205ENST00000588780 IL12RB2Q99665 862 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC187A0A096LP49 1063 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP9BO43861 1147 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 LINC00303Q3SY05 128 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 LMX1AQ8TE12 382 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 HSFY1Q96LI6 401 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC114Q96M63 670 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-205ENST00000588780 VPS28Q9UK41 221 aa22.35■■□□□ 1.17
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