RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584582.5

TOP3A-217, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 3,661 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-217ENST00000584582 IFNEQ86WN2 208 aa11.51□□□□□ -0.57
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TOP3A-217ENST00000584582 C9JVG2 144 aa11.49□□□□□ -0.57
TOP3A-217ENST00000584582 PRRG1O14668 218 aa11.49□□□□□ -0.57
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