RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579458.1

PCAT18-201, prostate cancer associated transcript 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PCAT18, Length 2,598 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCAT18-201ENST00000579458 DMC1Q14565 340 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 USH1GQ495M9 461 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 AMZ2Q86W34 360 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 ELMOD2Q8IZ81 293 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 SEMA3CQ99985 751 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 C8orf4Q9NR00 106 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 WWOXQ9NZC7 414 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 MBD2Q9UBB5 411 aa9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PCAT18-201ENST00000579458 DLGAP3O95886 979 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 IL2RAP01589 272 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 FTLP02792 175 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ADRA1DP25100 572 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 SLC26A2P50443 739 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 MAPRE2Q15555 327 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 INSCQ1MX18 579 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 GPAT3Q53EU6 434 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 RANBP10Q6VN20 620 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 OTUD5Q96G74 571 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 SAMD8Q96LT4 415 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TRIM4Q9C037 500 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 KLHL25Q9H0H3 589 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 HIPK3Q9H422 1215 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 NUDT15Q9NV35 164 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 PKD2L2Q9NZM6 624 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ZNF510Q9Y2H8 683 aa9.96□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 AKR7A2O43488 359 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 NUDT7P0C024 238 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 UMPSP11172 480 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TUBB4BP68371 445 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 UGP2Q16851 508 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 VPS36Q86VN1 386 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 SH2D3CQ8N5H7 860 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TTLL6Q8N841 843 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 SLC9A6Q92581 669 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 MMP19Q99542 508 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 RAB20Q9NX57 234 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 DLC1Q96QB1 1528 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 E7ENQ6 273 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TNFRSF10CO14798 259 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 MFN2O95140 757 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 OTCP00480 354 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TK1P04183 234 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 GRK4P32298 578 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ETV5P41161 510 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 BMXP51813 675 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 GFRA1P56159 465 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 HSPA14Q0VDF9 509 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 DUSP4Q13115 394 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 MOGQ16653 247 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 CES3Q6UWW8 571 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 HDXQ7Z353 690 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 ZNF384Q8TF68 577 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 CORO2AQ92828 525 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 NT5C3BQ969T7 300 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 C7orf34Q96L11 122 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TMEM68Q96MH6 324 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 SLC6A18Q96N87 628 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 TTYH3Q9C0H2 523 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 C17orf75Q9HAS0 396 aa9.95□□□□□ -0.82
PCAT18-201ENST00000579458 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms