RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 EGFP01133 1207 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 DCNP07585 359 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 RBP3P10745 1247 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 CHRNB1P11230 501 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 AOC1P19801 751 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 CD70P32970 193 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 ACVRL1P37023 503 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 SLC12A1Q13621 1099 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 CCNG2Q16589 344 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 TMEM196Q5HYL7 178 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 IL31Q6EBC2 164 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 GRAMD4Q6IC98 578 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 PRELID2Q8N945 189 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 FEM1AQ9BSK4 669 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 LRRC19Q9H756 370 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 SP110Q9HB58 689 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 FBXO10Q9UK96 956 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.85□□□□□ -1.31
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PRPF8-210ENST00000574217 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.85□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC188H7C350 402 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 CBX4O00257 560 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 KDELR3O43731 214 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 MAFKO60675 156 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 KAT7O95251 611 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 CISD3P0C7P0 127 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 CTAGE8P0CG41 777 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 DRD1P21728 446 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 CCNCP24863 283 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 AVPR2P30518 371 aa6.84□□□□□ -1.31
PRPF8-210ENST00000574217 CHRNA3P32297 505 aa6.84□□□□□ -1.31
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