RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	COL6A3	P12111	3177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	IKBKB	O14920	756 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ABLIM3	O94929	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	IL18BP	O95998	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC192	P0DO97	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC9A1	P19634	815 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TYMP	P19971	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	BDNF	P23560	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2F1	P24903	491 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ANXA13	P27216	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PCSK1	P29120	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SDHA	P31040	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ATIC	P31939	592 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	USP8	P40818	1118 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CETN1	Q12798	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR17	Q13304	367 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNC3	Q14003	757 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	UBR7	Q8N806	425 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ITFG1	Q8TB96	612 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GPT2	Q8TD30	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CLDN5	O00501	218 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF197	O14709	1029 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	VNN1	O95497	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GNA14	O95837	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	MBD3	O95983	291 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP17A1	P05093	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	TPM2	P07951	284 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	RHO	P08100	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF28	P17035	718 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ADORA2B	P29275	332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR15	P49685	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	NDST1	P52848	882 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	PLD1	Q13393	1074 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-238	ENST00000556288	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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