RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PON1	P27169	355 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	LSS	P48449	732 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PSMD8	P48556	350 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CLDN6	P56747	220 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DAB2	P98082	770 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	UBXN1	Q04323	297 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	KCNMA1	Q12791	1236 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CETN1	Q12798	172 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MTA1	Q13330	715 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SYCP1	Q15431	976 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CNGA2	Q16280	664 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PMF1	Q6P1K2	205 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TMEM270	Q6UE05	265 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	GBP6	Q6ZN66	633 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	BEND5	Q7L4P6	421 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	STK40	Q8N2I9	435 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	LMO3	Q8TAP4	145 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	UBA3	Q8TBC4	463 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	IFT43	Q96FT9	208 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SLC39A13	Q96H72	371 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	HIC2	Q96JB3	615 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DPH1	Q9BZG8	443 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SIX2	Q9NPC8	291 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	AKAP13	Q12802	2813 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	KNTC1	P50748	2209 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	LGALS16	A8MUM7	142 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688		B8ZZF3	427 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PIK3R2	O00459	728 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TRIM38	O00635	465 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	MCF2L	O15068	1137 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SIGLEC6	O43699	453 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	OPA1	O60313	960 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SERPINC1	P01008	464 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	APOE	P02649	317 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TPM2	P07951	284 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ALPPL2	P10696	532 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SLC2A3	P11169	496 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CKMT1A	P12532	417 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	C6	P13671	934 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DRD3	P35462	400 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ACADSB	P45954	432 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PLK1	P53350	603 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DCAF6	Q58WW2	860 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FSCB	Q5H9T9	825 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PCSK4	Q6UW60	755 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SLC25A45	Q8N413	288 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	OR4C6	Q8NH72	309 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	ABCG4	Q9H172	646 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	RBSN	Q9H1K0	784 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	PREB	Q9HCU5	417 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	THSD1	Q9NS62	852 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CS-233	ENST00000552688	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	7.05	□□□□□ -1.28

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