RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 ZFATQ9P243 1243 aa21.37■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 H7C4K7 107 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 CSPG5O95196 566 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 GSTA2P09210 222 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 NEFHP12036 1026 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 BGNP21810 368 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 CHRNA4P43681 627 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 COG7P83436 770 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 POU6F1Q14863 301 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 C16orf46Q6P387 395 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 CERS2Q96G23 380 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 IGSF21Q96ID5 467 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 CAPN7Q9Y6W3 813 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 ETFBP38117 255 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 ITKQ08881 620 aa21.36■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.36■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 TTC16Q8NEE8 873 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 PSMG2Q969U7 264 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 GLOD4Q9HC38 313 aa21.36■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa21.35■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa21.35■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 ACRP10323 421 aa21.35■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 SLC10A7Q0GE19 358 aa21.35■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 VAT1Q99536 393 aa21.35■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 GKN1Q9NS71 199 aa21.35■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.35■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.35■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 SPATA31D3P0C874 917 aa21.35■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 CHD7Q9P2D1 2997 aa21.35■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 SPATA17Q96L03 361 aa21.34■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 PRKAG3Q9UGI9 489 aa21.34■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 SLC25A41Q8N5S1 370 aa21.34■■□□□ 1.01
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PRDM4-205ENST00000550376 SERPINB4P48594 390 aa21.33■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 PDE1BQ01064 536 aa21.33■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 CES4AQ5XG92 561 aa21.33■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 SLC8B1Q6J4K2 584 aa21.33■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM135Q86UB9 458 aa21.33■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 MTRRQ9UBK8 725 aa21.33■■□□□ 1.01
PRDM4-205ENST00000550376 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa21.33■■□□□ 1.01
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