RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532321.1

CKAP5-211, Transcript of cytoskeleton associated protein 5, humanhuman

TSL 4

Gene CKAP5, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5-211ENST00000532321 P2RY11Q96G91 374 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 MYRFLQ96LU7 910 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 YME1L1Q96TA2 773 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SIK2Q9H0K1 926 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 VPS37BQ9H9H4 285 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 NMUR1Q9HB89 426 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 RXFP1Q9HBX9 757 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 HAUS2Q9NVX0 235 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF358Q9NW07 568 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 MARCH2Q9P0N8 246 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SENP1Q9P0U3 644 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 GMIPQ9P107 970 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 LGALS13Q9UHV8 139 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 ASB3Q9Y575 518 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.46□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SLC12A8A0AV02 714 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 WDR27A2RRH5 827 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 ARHGAP42A6NI28 874 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SDR42E2A6NKP2 422 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 DRGXA6NNA5 263 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 E9PAM4 449 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 FAM72CH0Y354 149 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 RNF103O00237 685 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 MATN3O15232 486 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 MFSD11O43934 449 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 ANXA9O76027 345 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 NEBLO76041 1014 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SHBGP04278 402 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 APRTP07741 180 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 PFKLP17858 780 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 STX2P32856 288 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 MDH1P40925 334 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 GARSP41250 739 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 NPY2RP49146 381 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SLC11A2P49281 568 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 HARS2P49590 506 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 GPR15P49685 360 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 EPHB3P54753 998 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 EFEMP1Q12805 493 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 BBS9Q3SYG4 887 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 TEX44Q53QW1 395 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 FNBP1LQ5T0N5 605 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 HECTD3Q5T447 861 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 TMCO4Q5TGY1 634 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 RASIP1Q5U651 963 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 KCTD16Q68DU8 428 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 LRRC8BQ6P9F7 803 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 ZNF449Q6P9G9 518 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 FIGNL1Q6PIW4 674 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 LEKR1Q6ZMV7 388 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 CCDC149Q6ZUS6 474 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 PRUNE1Q86TP1 453 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 LINC00523Q86TU6 105 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 FAM72BQ86X60 149 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 FIBCD1Q8N539 461 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 CCDC110Q8TBZ0 833 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 PLD4Q96BZ4 506 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 VWCEQ96DN2 955 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 C9orf72Q96LT7 481 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 UCN2Q96RP3 112 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 CYTH2Q99418 400 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 CLSTN3Q9BQT9 956 aa5.45□□□□□ -1.54
CKAP5-211ENST00000532321 MAGEB5Q9BZ81 275 aa5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms