RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526255.1

RCOR3-208, Transcript of REST corepressor 3, human

TSL 1 (best)

Gene RCOR3, Length 909 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCOR3-208	ENST00000526255	KAZN	Q674X7	775 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ELP4	Q96EB1	424 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PRY	O14603	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF213	O14771	459 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ZBED4	O75132	1171 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SGPL1	O95470	568 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PRPH2	P23942	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FPR3	P25089	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HOXD12	P35452	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	AGTR2	P50052	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF84	P51523	738 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GAB1	Q13480	694 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	BECN1	Q14457	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CCDC142	Q17RM4	750 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	STAM	Q92783	540 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CD180	Q99467	661 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SUFU	Q9UMX1	484 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	HFM1	A2PYH4	1435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FMN1	Q68DA7	1419 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	TNFSF14	O43557	240 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MT-CO3	P00414	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	WEE2	P0C1S8	567 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	PEPD	P12955	493 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	LAMP2	P13473	410 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ENG	P17813	658 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NDUFS1	P28331	727 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SLC8A1	P32418	973 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GJC1	P36383	396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	STAT6	P42226	847 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MTNR1A	P48039	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	POLD2	P49005	469 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ADPRH	P54922	357 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SLC37A1	P57057	533 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	DMWD	Q09019	674 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	MPP3	Q13368	585 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	KRT32	Q14532	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GPR162	Q16538	588 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	NFIL3	Q16649	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255		Q6YL49	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	RTL10	Q7L3V2	364 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	GALNT7	Q86SF2	657 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCOR3-208	ENST00000526255	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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