RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM38O00635 465 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 KLK10O43240 276 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 USP12O75317 370 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 VDRP11473 427 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 DRD3P35462 400 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 LSSP48449 732 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 VAC14Q08AM6 782 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 LY6DQ14210 128 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 MAN2A1Q16706 1144 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CBWD6Q4V339 395 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 FSCBQ5H9T9 825 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 MS4A13Q5J8X5 152 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 TRIM69Q86WT6 500 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 AOPEPQ8N6M6 819 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 TSPY26PQ9H489 355 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 CBX8Q9HC52 389 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA1257Q9ULG3 409 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 TLR6Q9Y2C9 796 aa14.65□□□□□ -0.06
UBASH3B-202ENST00000525711 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 ARHGAP6O43182 974 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 OPA1O60313 960 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 CKMT1AP12532 417 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 SULT2A1Q06520 285 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 NNTQ13423 1086 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 CUL2Q13617 745 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC12A1Q13621 1099 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 VWA3BQ502W6 1294 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 DCAF6Q58WW2 860 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 TMC6Q7Z403 805 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 CFAP52Q8N1V2 620 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM131CQ96AQ9 280 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 MED8Q96G25 268 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 SEMA4CQ9C0C4 833 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 ABCG4Q9H172 646 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 TJP2Q9UDY2 1190 aa14.64□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 O00370 1275 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 PIK3R2O00459 728 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 FFAR2O15552 330 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC28A2O43868 658 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 RTN2O75298 545 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 CSO75390 466 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 GABBR2O75899 941 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 FBXO21O94952 628 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 APOEP02649 317 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 GP1BAP07359 652 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 THEGLP0DJG4 465 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 DGKAP23743 735 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 RGS7P49802 495 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 MIIPQ5JXC2 388 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 APCDD1Q8J025 514 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC25A45Q8N413 288 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 UBR7Q8N806 425 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 LMO3Q8TAP4 145 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC9Q92623 222 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 NDST4Q9H3R1 872 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 USP29Q9HBJ7 922 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1B0GVM2 712 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 NEMP2A6NFY4 417 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 TPM4P67936 248 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 KCNMA1Q12791 1236 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 KRT31Q15323 416 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 POM121L1PQ3SYA9 428 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 LCLAT1Q6UWP7 414 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 LUZP1Q86V48 1076 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 CHSY1Q86X52 802 aa14.62□□□□□ -0.07
UBASH3B-202ENST00000525711 LGI2Q8N0V4 545 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms