RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 CTHP32929 405 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ETFBP38117 255 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 OXCT1P55809 520 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ARF5P84085 180 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PHTF2Q8N3S3 785 aa23.23■■□□□ 1.31
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TSNARE1-208ENST00000524325 CIPCQ9C0C6 399 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 RETREG1Q9H6L5 497 aa23.23■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 SP110Q9HB58 689 aa23.23■■□□□ 1.31
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TSNARE1-208ENST00000524325 K7ERQ8 282 aa23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PHF2O75151 1096 aa23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ZMPSTE24O75844 475 aa23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ETS1P14921 441 aa23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 STK19P49842 368 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 TUBB2AQ13885 445 aa23.22■■□□□ 1.31
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TSNARE1-208ENST00000524325 SLC45A4Q5BKX6 768 aa23.22■■□□□ 1.31
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TSNARE1-208ENST00000524325 TUBB2BQ9BVA1 445 aa23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC2A11Q9BYW1 496 aa23.22■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 CA14Q9ULX7 337 aa23.22■■□□□ 1.31
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TSNARE1-208ENST00000524325 MBLAC2Q68D91 279 aa23.21■■□□□ 1.31
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TSNARE1-208ENST00000524325 USP29Q9HBJ7 922 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 AMACRQ9UHK6 382 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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TSNARE1-208ENST00000524325 NUP205Q92621 2012 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 F5H423 210 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 PEX11BO96011 259 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB17Q13105 803 aa23.21■■□□□ 1.31
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TSNARE1-208ENST00000524325 SLC44A4Q53GD3 710 aa23.21■■□□□ 1.31
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF783Q6ZMS7 281 aa23.21■■□□□ 1.31
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TSNARE1-208ENST00000524325 KAT7O95251 611 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 CD160O95971 181 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 IFNB1P01574 187 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 CLCN6P51797 869 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 EMC10Q5UCC4 262 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC105Q8IYK2 499 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 GJD3Q8N144 294 aa23.2■■□□□ 1.3
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TSNARE1-208ENST00000524325 P2RY13Q9BPV8 354 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 PDFQ9HBH1 243 aa23.2■■□□□ 1.3
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TSNARE1-208ENST00000524325 HPCAL4Q9UM19 191 aa23.2■■□□□ 1.3
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TSNARE1-208ENST00000524325 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.2■■□□□ 1.3
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TSNARE1-208ENST00000524325 XRCC4Q13426 336 aa23.2■■□□□ 1.3
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TSNARE1-208ENST00000524325 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 AHI1Q8N157 1196 aa23.2■■□□□ 1.3
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TSNARE1-208ENST00000524325 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF4L2Q8NA75 395 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 HTR3CQ8WXA8 447 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 DNASE1L2Q92874 299 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 ERLEC1Q96DZ1 483 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 RAD54BQ9Y620 910 aa23.2■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 PLK1P53350 603 aa23.19■■□□□ 1.3
TSNARE1-208ENST00000524325 WASHC5Q12768 1159 aa23.19■■□□□ 1.3
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