RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511276.1

FAM53C-208, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 4

Gene FAM53C, Length 571 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	DMAC2	Q9NW81	257 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		13.64	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	IKBKB	O14920	756 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	AQP9	O43315	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CSF2	P04141	144 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	HGF	P14210	728 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CASR	P41180	1078 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	TBX4	P57082	545 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	FZD2	Q14332	565 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	DCAF6	Q58WW2	860 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	HORMAD1	Q86X24	394 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	TATDN2	Q93075	761 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	KLF15	Q9UIH9	416 aa		13.63	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276		A6NNZ2	444 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276		H3BM21	787 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	TPP1	O14773	563 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	RAD23B	P54727	409 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	AMPD3	Q01432	767 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	NCAPH	Q15003	741 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	E2F4	Q16254	413 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ACCSL	Q4AC99	568 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	NAT6	Q93015	286 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	BMF	Q96LC9	184 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	IL12RB2	Q99665	862 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	BOC	Q9BWV1	1114 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.62	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	POM121B	A6NF01	834 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	MCF2L	O15068	1137 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ZNF18	P17022	549 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	RPIA	P49247	311 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PARG	Q86W56	976 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	LMX1A	Q8TE12	382 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PISD	Q9UG56	409 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		13.61	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ALOX15B	O15296	676 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	JUND	P17535	347 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CASP1	P29466	404 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	DAOA	P59103	153 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SULT2A1	Q06520	285 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276		Q6ZVU0	165 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	LGI2	Q8N0V4	545 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SCML4	Q8N228	414 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	GLMN	Q92990	594 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	STRADB	Q9C0K7	418 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	CISH	Q9NSE2	258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.6	□□□□□ -0.23
FAM53C-208	ENST00000511276	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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