RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDYLQ9Y232 598 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CENPXA8MT69 81 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TGDSO95455 350 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MSH3P20585 1137 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPL26P61254 145 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EMC2Q15006 297 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIPR1Q53HC9 387 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BTBD6Q96KE9 485 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLEKHF1Q96S99 279 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NENFQ9UMX5 172 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LCA5LO95447 670 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CYB5AP00167 134 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ITIH1P19827 911 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HLA-DPA1P20036 260 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UGT1A5P35504 534 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACTR2P61160 394 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RTL6Q6ICC9 239 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTLL2Q9BWV7 592 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDP2Q9P2J9 529 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABLIM1O14639 778 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TPBGLP0DKB5 382 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SLC30A5Q8TAD4 765 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GJA10Q969M2 543 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANAPC7Q9UJX3 599 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHP2O43745 196 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DIAPH2O60879 1101 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF217O75362 1048 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TAF5LO75529 589 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CBSLP0DN79 551 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CBSP35520 551 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDST2P52849 883 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SSX1Q16384 188 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPAMQ9HCL2 828 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MTMR4Q9NYA4 1195 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACTR3BQ9P1U1 418 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PTPN9P43378 593 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MFSD13AQ14CX5 517 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NECTIN1Q15223 517 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARL9Q6T311 187 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC34Q8IZ02 419 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DPP10Q8N608 796 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STK32AQ8WU08 396 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ALG6Q9Y672 507 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A087X1B8 175 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 M0QYV0 167 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KRT75O95678 551 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ICA1LQ8NDH6 482 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNFSF13BQ9Y275 285 aa4.6□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C5orf60A6NFR6 353 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GUCA1CO95843 209 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STOMP27105 288 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DLG1Q12959 904 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 BNIP2Q12982 314 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPAS2Q99743 824 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMBIM4Q9HC24 238 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NMRK2Q9NPI5 230 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAPN11Q9UMQ6 739 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DTNAQ9Y4J8 743 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A0B4J269 797 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC53A6NM62 1247 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PSMB10P40306 273 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PSEN2P49810 448 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MC1RQ01726 317 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SP3Q02447 781 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.59□□□□□ -1.67
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms