RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494672.1

CCDC66-222, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-222	ENST00000494672	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CTAG1A	P78358	180 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	GPS1	Q13098	491 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	BFSP2	Q13515	415 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	TNIP1	Q15025	636 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	KAT2B	Q92831	832 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	NOTCH4	Q99466	2003 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF814	B7Z6K7	855 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672		M0QX08	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	HSPA1L	P34931	641 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CA8	P35219	290 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	MNAT1	P51948	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	RCN1	Q15293	331 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	WDR24	Q96S15	920 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	COG5	Q9UP83	839 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	KDR	P35968	1356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM94	Q12767	1356 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	PRY	O14603	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	UGDH	O60701	494 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ZBED4	O75132	1171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	NDUFB8	O95169	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	AR	P10275	920 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	FER	P16591	822 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CD9	P21926	228 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CDC25A	P30304	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	NF2	P35240	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	HSD17B7	P56937	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	MORC3	Q14149	939 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	BOLA3	Q53S33	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCDC66-222	ENST00000494672	PELI3	Q8N2H9	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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