RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	BMPR2	Q13873	1038 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TPSAB1	Q15661	275 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PDK4	Q16654	411 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	UPP1	Q16831	310 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	DCAF6	Q58WW2	860 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	STEAP4	Q687X5	459 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM171B	Q6P995	826 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PALM2	Q8IXS6	379 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PDIK1L	Q8N165	341 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	VPS52	Q8N1B4	723 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	STKLD1	Q8NE28	680 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MCU	Q8NE86	351 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF139	Q8WU17	664 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	C10orf82	Q8WW14	230 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MYLPF	Q96A32	169 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SGSM3	Q96HU1	749 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	B3GALT6	Q96L58	329 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SPATA13	Q96N96	652 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TCF25	Q9BQ70	676 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MED10	Q9BTT4	135 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CHKB	Q9Y259	395 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PLXNA3	P51805	1871 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CEP290	O15078	2479 aa		5.96	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR27	A2RRH5	827 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	HIDE1	A8MVS5	230 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF103	O00237	685 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CREB3	O43889	395 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	KIAA0754	O94854	1291 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	GSR	P00390	522 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	APOE	P02649	317 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	OR4Q2	P0C623	313 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM200B	P0CF97	657 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ALAD	P13716	330 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ERCC2	P18074	760 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT4	P19013	534 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CA4	P22748	312 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPN3	P26045	913 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	MGAT1	P26572	445 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PSMB4	P28070	264 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PPM1A	P35813	382 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNJ2	P63252	427 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	IL9R	Q01113	521 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	DEUP1	Q05D60	604 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	BNIP1	Q12981	228 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ZBTB17	Q13105	803 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	NR1H3	Q13133	447 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	NME3	Q13232	169 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	RNF43	Q68DV7	783 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	CES3	Q6UWW8	571 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	RFX8	Q6ZV50	586 aa		5.95	□□□□□ -1.46
C4BPB-208	ENST00000492730	SCD5	Q86SK9	330 aa		5.95	□□□□□ -1.46

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