RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489603.5

LRRFIP1-214, Transcript of LRR binding FLII interacting protein 1, human

TSL 3

Gene LRRFIP1, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRFIP1-214	ENST00000489603	LGALS16	A8MUM7	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603		B5MCH6	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MYO1F	O00160	1098 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SYT5	O00445	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NPC1	O15118	1278 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HBP1	O60381	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PLOD3	O60568	738 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GLUL	P15104	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GAP43	P17677	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HK1	P19367	917 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SERPINF1	P36955	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	LGALS4	P56470	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SNAP25	P60880	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CDK17	Q00537	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FMO1	Q01740	532 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	COL10A1	Q03692	680 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CETN1	Q12798	172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	IL10RA	Q13651	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FGL2	Q14314	439 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	KAT5	Q92993	513 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZNF302	Q9NR11	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RPTOR	Q8N122	1335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	AHRR	A9YTQ3	701 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PSMA7	O14818	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SLC16A6	O15403	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SEPT4	O43236	478 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CHMP2A	O43633	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TMEM127	O75204	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	GGPS1	O95749	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ABHD16A	O95870	558 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TPM1	P09493	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FLT3LG	P49771	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	EFNA5	P52803	228 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DCAF7	P61962	342 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PTPA	Q15257	358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TAF11	Q15544	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CNGA2	Q16280	664 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	KYAT1	Q16773	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	RESP18	Q5W5W9	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	MLKL	Q8NB16	471 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LRRFIP1-214	ENST00000489603	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62

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