RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 CEP85LQ5SZL2 805 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 CNTD1Q8N815 330 aa27.38■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 SH3GL2Q99962 352 aa27.38■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 GFRA2O00451 464 aa27.34■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 ATP11CQ8NB49 1132 aa27.34■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
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HOXB3-210ENST00000489475 GORASP1Q9BQQ3 440 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXB3-210ENST00000489475 DZANK1Q9NVP4 752 aa27.34■■□□□ 1.97
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